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Il existe une grande variété de matières organiques, surtout végétales, qui peuvent être compostées. Toutefois, certains matériaux ne devraient pas l’être. Par exemple, les excréments d’animaux domestiques tels les chats et les chiens peuvent renfermer certains pathogènes causant des maladies qui peuvent être transmises aux humains. On devrait alors éviter de les composter ou bien, si on choisit de les utiliser, il ne faut pas appliquer le compost qui en résulte dans le potager.
On devrait également éviter de composter les tubercules de pommes de terre atteintes par le mildiou, car les champignons responsables de la maladie sont difficiles à détruire par le processus de compostage. Pour leur part, les mauvaises herbes annuelles ne devraient pas être compostées, car elles produisent de nombreuses graines qui, généralement, ne sont pas détruites. Finalement, le papier imprimé avec beaucoup d’encre de couleur ne doit pas être intégré au tas de compost.
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